清水泵的结构是一个电机和水泵的组合，清水泵只是用来输送清水，所以清水泵的叶轮之间的空隙就很小，这样的话，如果在工作的过程中产生杂物，就会容易堵塞在叶轮里面。这样就不能转动，故障就这样发生了。
第一：污水泵为了避免杂物堵塞管道，一般都把流道设计的很宽。因此污水泵的效率自然就偏低了，所以通常污水泵的扬程普遍都不高，而清水泵的输送管道都很窄，它的扬程也自然很高，效率也就更高了。
第二：污水泵为了更好排出杂质，叶轮的结构将会设计的没有清水泵那么复杂，另外专门设置了一些锯齿，将那些颗粒大的杂物弄碎以后，不让杂物缠绕在叶轮上面，并且可以顺利的排出去，但是清水泵的叶轮就没有这么简单了，所以它的工作效率会更高。
第三：污水泵长期用来排除固体以及很大的颗粒杂物，肯定会有一定的摩擦，这些摩擦会对污水泵造成一些损伤，所以污水泵的耐磨程度和清水泵比起来都比较好，在机器的密封件上都采用抗腐蚀很强的零件。这是它们不同的作用的造成的，清水泵就不需要考虑这些问题了。
上海速能泵阀技术人员总结称，清水泵与污水泵的主要不同就是它们的结构，叶轮和流道在设计上的不同，以及别的零部件的配置，造成这些不同的原因也因为它们的使用情况和作用的场合是不一样的。正是因为它们运用的情况真好相反，以至于它们在制造的时候结构就有明显的区别。清水泵扬程高，污水泵扬程低；清水泵流量相对较小，污水泵流量相对较大；污水泵可以输送清水，清水泵不能输送污水。
